حجت الاسلام مظفری طی مکاتبه ای خطاب به وزیر بهداشت، درمان و آموزش پزشکی موضوع پرداخت فوق العاده جذب و نگهداری و وجوه مرخصی مناطق محروم به کارکنان دانشگاه های علوم پزشکی را از مصادیق تبصره ماده 11 قانون دیوان قلمداد کرد و پیامدهای عدم اجرای آن را متذکر شد .